Akoya Biosciences是Akoya Biosciences，Inc.（一家特拉華州公司）的注冊(cè)商標(biāo)，而Spatial Biology Company是Akoya Biosciences，Inc.的商標(biāo)。 

akoyabio空間分辨，多重免疫熒光的全面解決方案

表征組織微環(huán)境的復(fù)雜性是理解驅(qū)動(dòng)疾病以及治療反應(yīng)的分子和細(xì)胞機(jī)制的關(guān)鍵要素。

浸潤(rùn)的免疫細(xì)胞和細(xì)胞基質(zhì)重塑之間的空間關(guān)系作用被廣泛認(rèn)為是定義組織異質(zhì)性的關(guān)鍵成分。CODEX系統(tǒng)使研究人員能夠以單細(xì)胞分辨率對(duì)組織樣品中的40多種蛋白質(zhì)標(biāo)記物成像。高度復(fù)用的成像技術(shù)可以研究不同的細(xì)胞表型，以及它們?nèi)绾卧谠幌嗷プ饔靡杂绊懠膊〉牟±砗瓦M(jìn)展。

CODEX技術(shù)

CODEX（通過indEXing進(jìn)行共檢測(cè)）技術(shù)使用與專有Akoya條形碼偶聯(lián)的抗體，該條形碼由*的寡核苷酸序列組成。CODEX分析法使用染料標(biāo)記的Reporter靶向特定條形碼，以進(jìn)行高度特異性的檢測(cè)。

用CODEX抗體板對(duì)組織樣品進(jìn)行單步染色，然后Reporters通過成像和去除的迭代循環(huán)與互補(bǔ)條形碼結(jié)合。循環(huán)由CODEX流體力學(xué)儀器*自動(dòng)化。

靈活

為新鮮的冷凍或FFPE組織設(shè)計(jì)定制面板

樣品友好

可以對(duì)樣本重新成像以進(jìn)行感興趣區(qū)域（ROI）分析

可擴(kuò)展

以單細(xì)胞分辨率在單個(gè)組織樣本中成像40+個(gè)標(biāo)記

全面

包括試劑和軟件分析套件

CODEX復(fù)用成像示例

CODEX解決方案與許多組織類型和格式兼容。

人類乳腺FFPE組織被36重面板染色

• 鈣粘蛋白
• KRT19
• KRT17
• 肌動(dòng)蛋白
• Ki67
• CD31
• DAPI

肺癌FFPE組織被28重面板染色

• 泛細(xì)胞角蛋白
• CD8
• Ki67
• PD-L1
• PD-1
• CD68

人體皮膚新鮮的冷凍組織沾有26層面板

• 泛細(xì)胞角蛋白
• CD138
• CD49f
• CD45
• CD34
• Podoplanin
• CD31

固定人PBMC并用26重面板染色

• Ki67
• CD45
• CD2
• CD31
• CD63
• CD45
• CD7

腎細(xì)胞癌FFPE組織用15重面板染色

• Ki67
• CD8
• CD4
• Podoplanin
• SMA
• CD20
• CD31

實(shí)驗(yàn)工作流程

01

弄臟

使用CODEX抗體面板準(zhǔn)備和染色組織只需一步即可，從而減少了周轉(zhuǎn)時(shí)間并保持了樣品完整性。

02

圖片

全自動(dòng)CODEX儀器和配套顯微鏡在您的組織中對(duì)40多個(gè)標(biāo)記圖像進(jìn)行成像。用戶可以將目標(biāo)分辨率降至20倍的單細(xì)胞分辨率，將目標(biāo)分辨率降至40倍的亞細(xì)胞分辨率。

03

分析

使用全面的CODEX軟件套件處理，分析和可視化圖像。用戶可以訪問可視化工具，如用于細(xì)胞表型的門控和聚類。用戶還可以導(dǎo)出文件以在第三方軟件中使用。

醫(yī)學(xué)博士安德拉斯·阿·赫茲（Andras A Heczey）

丹·L·鄧肯綜合癌癥中心兒科腫瘤學(xué)助理教授

貝勒醫(yī)學(xué)院

輸液后活檢非常珍貴……借助CODEX，我們的目標(biāo)是從組織的小樣本中獲取多的數(shù)據(jù)，以盡可能多地了解腫瘤的微環(huán)境。

Garry Nolan博士

Rachford和Carlota A. Harris微生物學(xué)和免疫學(xué)系教授

斯坦福大學(xué)，Akoya Biosciences聯(lián)合創(chuàng)始人

CODEX的商業(yè)發(fā)布是我實(shí)驗(yàn)室的一個(gè)里程碑，也是生物醫(yī)學(xué)科學(xué)的一個(gè)令人興奮的機(jī)會(huì)。同時(shí)經(jīng)濟(jì)地分析完整組織上數(shù)十種或更多種蛋白質(zhì)標(biāo)記的能力將從根本上改變我們對(duì)細(xì)胞相互作用和疾病生物學(xué)的理解。

實(shí)例探究

范德比爾特糖尿病中心的Powers＆Brissova研究小組使用CODEX來研究胰島微環(huán)境。

斯坦福大學(xué)的細(xì)胞科學(xué)成像設(shè)施（CSIF）通過CODEX系統(tǒng)上的多重成像項(xiàng)目擴(kuò)展了其核心實(shí)驗(yàn)室服務(wù)。

賓夕法尼亞大學(xué)的研究人員開發(fā)了一種方法，可以將單細(xì)胞CITE-seq數(shù)據(jù)映射到CODEX復(fù)用IHC圖像，以進(jìn)行空間單細(xì)胞多組學(xué)研究。

CODEX分析試劑和抗體

CODEX分析法通過迭代成像循環(huán)靶向抗體組的子集，從而克服了傳統(tǒng)的多重免疫熒光技術(shù)的挑戰(zhàn)，從而在單個(gè)組織切片中揭示了40多種生物標(biāo)志物。

我們提供了完整的解決方案，其中包括針對(duì)CODEX系統(tǒng)進(jìn)行了優(yōu)化和驗(yàn)證的抗體和試劑。經(jīng)驗(yàn)證和庫存的抗體可用于不同類型的組織：小鼠新鮮冷凍，人新鮮冷凍和人FFPE。用戶可以使用Akoya的定制偶聯(lián)試劑盒靈活地創(chuàng)建由市售的，經(jīng)Akoya驗(yàn)證的抗體或標(biāo)有CODEX條形碼的克隆組成的面板。

試劑盒和試劑

用于組織染色，自定義綴合和執(zhí)行CODEX實(shí)驗(yàn)的緩沖液和試劑

CODEX抗體

CODEX共軛抗體，用于構(gòu)建抗體面板

CODEX條碼

修飾寡核苷酸，易于偶聯(lián)定制CODEX抗體

CODEX記者

熒光團(tuán)偶聯(lián)的寡核苷酸，用于CODEX抗體的可視化

試劑盒和試劑

CODEX分析需要專門配制的試劑和緩沖液，以使用CODEX抗體對(duì)組織染色并進(jìn)行迭代成像循環(huán)。對(duì)于每個(gè)成像周期，將三個(gè)帶有特定光譜染料的CODEX Reporter應(yīng)用于染色的組織，以可視化相應(yīng)的CODEX抗體。該CODEX儀器適用輕柔洗滌步驟去除CODEX記者無任何化學(xué)修飾，隨后施加下一組記者的想象下一組CODEX抗體。

CODEX抗體

CODEX抗體是單獨(dú)提供的，可以混合使用并與設(shè)計(jì)面板匹配，以同時(shí)分析多達(dá)40多種生物標(biāo)志物。

Akoya提供經(jīng)過充分測(cè)試的CODEX抗體和一系列補(bǔ)充抗體。

CODEX ^®盤點(diǎn)抗體

CODEX清單抗體由Akoya提供，并已通過完整的CODEX抗體驗(yàn)證過程和制造質(zhì)量控制。我們庫存的抗體也得到了我們現(xiàn)場(chǎng)支持團(tuán)隊(duì)的全面支持。

CODEX抗體已在多種類型的人類FFPE組織中進(jìn)行了測(cè)試。這些CODEX抗體與不同的CODEX條形碼（BX000）結(jié)合。每個(gè)試劑盒包含一管CODEX抗體和一管相應(yīng)的染料標(biāo)記的Reporter（RX000），在標(biāo)準(zhǔn)染色條件下有足夠的容量用于25 CODEX運(yùn)行（或測(cè)試）。推薦用于FFPE組織的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™750。

已經(jīng)使用扁桃體組織測(cè)試了用于人類新鮮冷凍組織的CODEX抗體。這些CODEX抗體與不同的CODEX條形碼（BX000）結(jié)合。每個(gè)試劑盒包含一管CODEX抗體和一管相應(yīng)的染料標(biāo)記的Reporter（RX000），在標(biāo)準(zhǔn)染色條件下有足夠的容量用于25 CODEX運(yùn)行（或測(cè)試）。推薦用于人類新鮮冷凍組織的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™488。

已使用脾臟組織測(cè)試了用于小鼠新鮮冷凍組織的CODEX抗體。這些CODEX抗體與不同的CODEX條形碼（BX000）結(jié)合。每個(gè)試劑盒包含一管CODEX抗體和一管相應(yīng)的染料標(biāo)記的Reporter（RX000），在標(biāo)準(zhǔn)染色條件下有足夠的容量用于25 CODEX運(yùn)行（或測(cè)試）。推薦用于小鼠新鮮冷凍組織的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™488。

CODEX ^®屏蔽抗體

Akoya并未列出或提供CODEX篩選的抗體，但包括一系列已純化并成功與CODEX Barcodes結(jié)合并在次級(jí)淋巴組織中顯示陽性染色信號(hào)的克隆。這些克隆可從其他抗體供應(yīng)商處商購獲得，但需要終用戶偶聯(lián)。CODEX條形碼和相關(guān)的共軛協(xié)議可通過Akoya獲得。

CODEX ^®社區(qū)抗體

CODEX用戶群在不斷增長(zhǎng)，我們鼓勵(lì)跨客戶站點(diǎn)的協(xié)作，以共享他們經(jīng)過CODEX測(cè)試的克隆和協(xié)議的列表。這些CODEX社區(qū)抗體雖然證明與CODEX儀器兼容，但不會(huì)通過Akoya出售。終用戶需要共軛。CODEX條形碼和相關(guān)的共軛協(xié)議可通過Akoya獲得。我們正在繼續(xù)擴(kuò)大名單。

CODEX ^®抗體的自定義面板設(shè)計(jì)

Akoya的CODEX系統(tǒng)為用戶提供了靈活性，可以使用自定義偶聯(lián)試劑盒創(chuàng)建由Akoya驗(yàn)證的抗體或標(biāo)有CODEX Barcodes的克隆組成的面板。用戶可以使用CODEX偶聯(lián)試劑盒和各個(gè)CODEX條形碼從第三方抗體供應(yīng)商處穩(wěn)健地制備克隆。

CODEX條碼

CODEX條形碼與CODEX偶聯(lián)試劑盒一起使用，可用于定制抗體面板設(shè)計(jì)。每個(gè)試劑盒均包含一管凍干條形碼，用于單個(gè)結(jié)合反應(yīng)；兩管Reporters，用于優(yōu)化CODEX抗體滴定和CODEX運(yùn)行。對(duì)于每個(gè)條形碼，都有足夠的體積用于50 µg抗體偶聯(lián)，根據(jù)產(chǎn)量和滴度，可以提供足夠的材料用于10至50個(gè)染色。